Sorteggio Martedì 2 Febbraio alle ore 16:00. Saranno sorteggiati 4 gironi da 4 squadre composti da due prime e due seconde classificate della prima fase.
Fascia 1: Tenerife (Spagna), Bursa (Turchia), Hapoel Holon (Israele), Saragozza (Spagna), Strasburgo (Francia), Bamberg (Germania), Turk Telekom Ankara (Turchia) e Burgos (Spagna)
Fascia 2: Dinamo Sassari (Italia), New Basket Brindisi (Italia) Nymburk (Repubblica Ceca), Aek Atene (Grecia), Nizhny Novgorod (Russia), Vef Riga (Lettonia), Pinar Karsiyaka (Turchia), Igokea (Bosnia)
Le prime due classificate di ogni girone accederanno alle Final Eight in programma dal 5 al 9 maggio.